2006年11月澳門特別行政區政府民政總署合約研究計劃，與香港中文大學中國考古藝術研究中心合作，組成聯合考古隊，於2006年11月18日至2006年12月31日在澳門路環黑沙進行「二零零六年澳門黑沙遺址考古發掘研究計劃」，本館鄭煒明博士出任該考古隊副領隊。此計劃已完成，並於2007年7月20日召開記者招待會，公布初步成果。